Le transcriptome correspond à l’ensemble molécules d’ARN transcrites dans une cellule ou une population de cellules, telles que les ARNm, ARNt, et ARN non codants. IntegraGen est un expert incontournable dans la réalisation d’études transcriptomiques et l’analyse d’expression de gènes.

RNA-Seq

Le RNA-Seq permet d’obtenir le profil transcriptomique d’un échantillon par séquençage haut-débit, et donne une analyse précise du niveau d’expression des transcrits et de leurs isoformes. IntegraGen possède une expertise reconnue en RNA-Seq, et accompagne les chercheurs de la conception à la mise en œuvre de leurs études d’expression.

Ce qui fait d’IntegraGen votre meilleur partenaire

  •  Expérience sur la palette complète des applications du RNA-Seq
  •  Service RNA-Seq à visée clinique dans le cadre des études de médecine personnalisée
  •  Mise en œuvre des Pipelines bioinformatiques de pointe, régulièrement testés et mis à jour
  •  Conseil technique et scientifique dans la conception expérimentale des projets
  •  Accompagnement du design de l’étude à l’analyse statistique des données via notre service GeCo – Advanced Genomics consulting

RNA seq integragen genomics 5

 

Séquençage de petits ARN

IntegraGen a perfectionné et optimisé son protocole pour mesurer l’expression des petits ARN (miRNA-Seq) dans les tissus et biopsies liquides (serum ou plasma) par séquençage nouvelle-génération. IntegraGen met également à disposition des technologies alternatives pour étudier les profils des petits ARN comme le panel miR, ou des approches de RT-QPCR.

Il existe différentes méthodes et technologies permettant d’étudier les profils d’expression ou de découvrir de nouveaux miR. IntegraGen Genomics dispose d’un panel de méthodes qui nous permettent de vous proposer l’approche la plus efficace pour répondre aux objectifs de votre projet dans vos contraintes de délai et de budget:  le séquençage haut-débit (smallRNA-Seq) et la RT-QPCR,.

IntegraGen est le prestataire privilégié de la Ligue Nationale contre le Cancer, et traite plusieurs centaines d’échantillons par an dans le cadre du programme Carte d’Identité des Tumeurs®.

  •  RNA-Seq-integragen-genomicsProcédé optimisé de l’extraction à l’analyse bioinformatique des données
  •  A partir de tissus congelés ou FFPE, de cellules sanguines circulantes, ou de biopsies liquides.
  •  Expertise dans l’extraction d’ARN total à partir de plasma ou sérum
  •  Préparation de banques utilisant des adaptateurs aléatoires résultant d’un développement propre des équipe d’IntegraGen
    •  Diminue significativemnet les biais de représentation
    •  Améliore la corrélation des résultats entre techniques
  •  Analyse bioinformatique de pointe avec snRNAbench

 

ANALYSES BIOINFORMATIQUES

IntegraGen Genomics accompagne les chercheurs à dépasser les challenges de l’analyse des données de RNA-Seq, en leur permettant d’extraire les informations pertinentes de la masse des données.

  • Identification des gènes et pathways différentiellement exprimés
  • Découverte d’évènements de novo
    • Transcrits de fusion
    • Variants d’épissage
    • Long ARN non-codants (lncRNA)

GeCo Genomics project plan and results (French2)