IntegraGen offers a broard variety of DNA-based sequencing solutions for oncology and rare disease research.

Séquençage d’Exome

IntegraGen propose un service haut de gamme de séquençage d’exome intégrant les dernières technologies disponibles, et des logiciels propriétaires pour l’analyse des données. Nous aidons nos clients à identifier les mutations d’intérêt dans les domaines des maladies rares, maladies complexes, et de la cancérologie.

Le séquençage d’exome permet aux chercheurs de cibler les régions codantes du génome pour réduire à la fois les coûts de séquençage, d’analyse, et de stockage des données. Les capacités d’analyse permettent maintenant d’appréhender des études sur de grandes cohortes.

NOTRE EXPERIENCE

  •  Notre laboratoire a séquencé plus de 7000 exomes depuis 2010HiSeq 4000 and Primadiag
  •  Nous collaborons avec des chercheurs de renom dans les différents domaines de la recherche en génétique humaine
    •  Maladies Rares
    •  Maladies complexes
    •  Oncologie
  •  Nous opérons une plateforme de séquençage d’exome et transcriptome à visée clinique
  •  Nos clients n’hésitent pas à nous citer dans leurs publications.
  •  Nous avons mis en place un robuste système de management de la qualité pour contrôler chaque étape clé du procédé de séquençage ; et un programme d’amélioration continue de la qualité pour tous les protocoles du laboratoire et d’analyses des données.

CE QUI FAIT DE NOUS VOTRE MEILLEUR PARTENAIRE

  •  Nous sommes capables de prendre en charge de faibles quantités d’ADN ou des échantillons dégradés (FFPE)
  •  Nos délais ne cessent de diminuer grâce à un investissement continu dans les dernières technologies :
    •  De séquenceur Illumina
  •  Nous avons l’expertise requise pour vous aider dans la conception de vos projets de recherche
  •  Nous disposons des compétences pour vous aider dans la prise en main des données et l’interprétation des résultats

NOS GARANTIES TECHNIQUES

  • Les meilleurs kits de capture pour toutes applications:
  • La garantie d’avoir environ 85% de couverture à 25X minimum
    • La profondeur minimum garantie dépend de l’objectif de votre projet
    • Nos recommandations standards: 70X pour un échantillon constitutionnel et 100X minimum pour un échantillon tumoral
    • Toute demande particulière est traitée avec le plus grand soin
  • Des contrôles qualités étendues incluant une traçabilité positive de vos échantillons

 

Séquençage de panel de gènes à façon

IntegraGen peut répondre à vos besoins spécifiques en séquençage ciblé pour identifier des variants à faible fréquence, que ce soit sur un panel de gènes à façon, ou un panel commercial existant. Nous pouvons vous aider à designer votre panel, et à choisir l’approche technologique la plus adaptée, pour vous faire gagner du temps tout en respectant vos contraintes de budget.

NOTRE EXPERIENCE

  •  Notre laboratoire a pris en charge des milliers d’échantillons depuis 2010
  •  Nous collaborons avec des chercheurs de renom dans les différents domaines de la génétique humaine :
    •  Maladies Rares
    •  Maladies complexes
    •  Oncologie
  •  Nous avons l’expertise nécessaire pour travailler les différents kits de capture du marché
  •  Nos clients n’hésitent pas à nous citer dans leurs publications

Nous avons mis en place un robuste système de management de la qualité pour contrôler chaque étape clé du procédé de séquençage ; et un programme d’amélioration continue de la qualité pour tous les protocoles du laboratoire et d’analyses des données.

CE QUI FAIT DE NOUS VOTRE MEILLEUR PARTENAIRE

  •  Nous avons une expertise éprouvée dans le design de panel de gènes
  •  Nous proposons aussi bien des panels à façon que des panels commerciaux existants
  •  Nos panels à façon peuvent être réalisés par capture ou par PCR multiplexes
  •  Les panels commerciaux proposes inclus les solutions et kits d’Agilent et Illumina
  •  Nous pouvons traiter plusieurs dizaines à centaines d’échantillons par projet grâce à l’automatisation d’étapes clés
  •  Nous disposons des compétences pour vous aider dans la prise en main des données et l’interprétation des résultats

 

Séquençage du Génome Entier

IntegraGen met son savoir-faire à votre disposition pour séquencer tous types de génome, combinant une palette de solutions de préparation de banques, à la dernière technologie de séquençage d’Illumina. Nous proposons des solutions bioinformatiques à la carte.

Pourquoi choisir IntegraGen Genomics ?

Nous avons validé et optimisé différentes solutions de préparation de banques :

  •  Banques paired-end
  •  Banques mate-pair
  •  Banque sans amplification (« PCR free »)
  •  A partir de faibles quantités d’ADN
  •  Par sonication ou tagmentation
  •  Nous avons une capacité de séquençage haut-débit sur notre plateforme Illumina

Nos garanties techniques

  •  Un contrôle qualité systématique de vos ADN à réception
  •  Des contrôles robustes à chaque étape clé de la préparation de la banque
  •  La garantie de la quantité et de la qualité des séquences

 

BIOINFORMATIque et analyse des données

  • Pipelines dédiés soit pour l’analyse de maladies mendeliennes, soit pour l’analyse somatique de cancer
  • Inclus l’analyse de CNV pour tous vos projets
  • Accès gratuit à SIRIUS, notre logiciel en ligne, pour filtrer et analyser simplement les variants et gènes, et comparer les échantillons. 
  • Accès aux résultats de séquençage à visée Clinique via MERCURY, notre logiciel propriétaire, qui permet d’accéder facilement et rapidement aux analyses et visualisation des résultats d’exome et transcriptome. 
  • Analyse de pointe des données via notre service GeCo:
    • Signatures mutationnelles et aberrations chromosomiques
    • Analyse de voies de signalisation